若御子神社の御創立は、当社歴代神官守屋家の伝記によれば、今から1280有余年程前、人皇第45代聖武天皇の御宇（奈良時代）天平年間（730年代）上田野の主峰、当時「神山」と称された今の若御子山の頂きに、守屋社家の祖先が十二社宮の祠を祀られたのが、当社御創立の起源と伝えられております。
　人皇第50代桓武天皇の御宇（平安時代）延暦13年（794年）に神山の峰岳に、守屋家の祖先がお社を造営し、御祭神（神日本磐余彦尊）神武天皇を奉斎し、「若御子十二社宮」と称されました。
　天文14年（1545年）に足利将軍義晴が若御子山の峰岳より旧社地若御子に社殿を造営し遷座、「若御子十二社権現宮」と称されました。
　明治2年（1869年）に「若御子神社」と名称変更され、大正5年（1916年）に若御子山より現在の地に遷座されました。

　当社は奈良時代に守屋社家が創建されてから近年まで、何代にも渡り守屋社家が神官を勤め、大神様をお守りしてまいりました。
　しかし、太平洋戦争にて、守屋社家血筋である社掌・守屋祐治氏が、出兵した戦地にて凶弾に倒れ、帰らぬ人となってしまいました。

　戦後、占領軍GHQの圧力により従来の体制が廃止され、新たな宗教法人として「神社本庁」が発足し、宗教法人法に従って組織的な神社運営が行われることとなりました。
　およそ1200有余年に渡り、血縁的関係で継承されてまいりました守屋社家の氏神様は、戦後を期に、地縁的関係の結びつきが強い「村社」へと変遷し、神官・神職も守屋社家から「神社本庁」系列の役職者へと受け継がれることになりました。
　現在は秩父市荒川上田野の旧家、笠原家の二級上宮司・笠原忠男氏が主宰となり、責任役員と奉賛会、氏子総代の協力の下、当社若御子神社をお守りされております。